Esami laboratorio: PCR

E’ stata creata una tabella con le indagini di biologia molecolare offerte dal Laboratorio con un dettaglio relativo ai substrati biologici che possono essere inviati. Se avete un caso particolare o necessitate di ulteriori informazioni vi preghiamo di contattare il Laboratorio prima di inviare i campioni.

La metodica PCR permette di individuare la presenza di un agente infettivo, tramite il reperimento del suo DNA o RNA. Inoltre la metodica da noi offerta prevede, oltre alla segnalazione o meno relativa all’agente infettivo ricercato, per alcuni agenti infettivi anche una valutazione semiquantitativa dello stesso. La quantificazione del DNA è di particolare interesse in corso di leishmaniosi.

Per ogni agente infettivo da noi ricercato sono segnalati i campioni su cui è possibile eseguire la ricerca e alcuni commenti. La ricerca può anche essere eseguita su tessuti freschi, conservati in soluzione fisiologica. Purtroppo i campioni tissutali conservati in formalina, presentano una degradazione del DNA che può determinare una negativizzazione del campione. E’ indispensabile contattare il Laboratorio prima di ogni richiesta speciale per valutare caso per caso l’idoneità del campione.

Si suggerisce di richiedere dei pannelli di malattie infettive invece che selezionare singole infezioni, per poi essere costretti ad integrare le richieste in caso di negatività, con inevitabile spreco di tempo e di risorse economiche. Infatti i nostri profili sono estremamente vantaggiosi dal punto di vista economico, perche’ la possibilità di sfruttare percorsi comuni e l’automazione di cui siamo dotati permette di ridurre in modo sostanziale il costo complessivo, nettamente inferiore rispetto a quello che si ottiene sommando le singole indagini.

Durante i mesi estivi è preferibile mantenere refrigerati i campioni. PCR non devono venire in contatto con terreni di trasporto o altro materiale.

I tempi di refertazione sono attualmente di circa 2-5 gg. lavorativi.

Per la genotipizzazione i tempi di refertazione son pari a 10 giorni.

Il costo degli esami di biologia molecolare si riferisce al singolo agente ricercato, da singolo campione biologico. Nel caso si richieda un esame su più di un campione, ogni ricerca aggiuntiva è ridotta del 50% rispetto al costo originale.

 

ESAMI – vedi anche l’elenco aggiornato, con tutti i substrati che possono essere indagati

Adenovirus respiratorio (CAV2)
Tampone orale, tampone oculo-congiuntivale, tampone nasale, lavaggio bronco-alveolare.

Aelurostrongylus abstrusus
Lavaggio bronco-alveolare, tampone naso-faringe, feci.

Anaplasma phagocytophilum/platis
Sangue intero in K3EDTA, aspirato midollare, aspirato linfonodale, liquido cefalorachidiano, liquido articolare.

Angiostrongylus vasorum
Sangue intero in K3EDTA, feci, lavaggio bronco-alveolare.

Aspergillus

Babesia spp
Sangue intero in K3EDTA, aspirato midollare; campione refrigerato.
Approfondimenti: Babesia spp

Babesia spp/Cytauxzoon spp
Sangue intero in K3EDTA; campione refrigerato.
Approfondimenti: Babesia spp/Cytauxzoon spp

Bartonella henselae
Sangue intero in K3EDTA, tampone orale; campione refrigerato.

Bartonella spp
Sangue intero in K3EDTA, tampone orale; campione refrigerato.

Bordetella bronchiseptica
Tampone orale, tampone oculo-congiuntivale, tampone nasale, lavaggio bronco-alveolare.

Borrelia burgdorferi
sinovia, sangue, liquor

Brucella spp.
Sangue intero in K3EDTA, aspirato linfonodale, urine, tampone vaginale, tampone prepuziale, liquido articolare; campione refrigerato.

Calicivirus
Tampone orale, tampone oculo-congiuntivale, tampone nasale, liquido articolare, lavaggio bronco-alveolare.

Chlamydophila psittaci
Tampone cloacale, tampone orale, tampone oculo-congiuntivale, tampone nasale, lavaggio bronco-alveolare.

Chlamydophila psittaci/felis
Tampone orale, tampone oculo-congiuntivale, tampone nasale, lavaggio bronco-alveolare.

Cimurro
Sangue intero in K3EDTA, aspirato linfonodale, urine, feci, tampone fecale, tampone orale, tampone oculo-congiuntivale, tampone nasale, liquido articolare, lavaggio bronco-alveolare, biopsia, paraffina; campione refrigerato.

Circovirus degli psittacidi
Tampone cloacale, tessuti (fegato, borsa di Fabrizio)

Coronavirus enterico (cane)
Sangue intero in K3EDTA, aspirato midollare, aspirato linfonodale, versamento, urine, feci, tampone fecale, liquido articolare, biopsia, paraffina; campione refrigerato.

Coronavirus (FeCoV/FIP)
Sangue intero in K3EDTA, aspirato midollare, aspirato linfonodale, versamento, urine, feci (si consiglia di non inviare feci prelevate da lettiere minerali ,sepiolite), tampone fecale, liquido articolare, biopsia, paraffina; campione refrigerato.

SARS-CoV-2 (COVID-19) NEW 2020
Utilizzare esclusivamente il tampone inviato dal Laboratorio. Substrati: tampone nasale, faringeo, laringe, lavaggio-broncoalveolare (bagnare il tampone nel lavaggio), tampone fecale

Cryptococcus neoformans
Feci, tampone fecale.

Cryptosporidium spp
Feci, tampone fecale.

Dirofilaria immitis
Sangue intero in K3EDTA; campione refrigerato.

Dirofilaria repens
Sangue intero in K3EDTA; campione refrigerato.

Ehrlichia canis (CME)
Sangue intero in K3EDTA, aspirato midollare, aspirato linfonodale, liquido cefalorachidiano, liquido articolare.

Ehrlichia spp
Sangue intero in K3EDTA, aspirato midollare, aspirato linfonodale, liquido cefalorachidiano, liquido articolare.

Encephalitozoon cuniculi
Urine, tessuto (rene)

Epatite infettiva di Rubarth (CAV1)
Sangue, aspirato epatico, tessuto (fegato), umor acqueo

FeLV (ricerca del Provirus)
Approfondimenti: FELV

FeLV (ricerca RNA virale)
Approfondimenti: FELV

FIV
Sangue in K3EDTA, aspirato midollare, tampone orale, biopsia, paraffina;campione refrigerato.

Genotipizzazione (sequenziamento diretto) per Parvovirosi
Genotipizzazione (Sequenziamento diretto): Anaplasma spp
Genotipizzazione (Sequenziamento diretto): Babesia spp
Genotipizzazione (Sequenziamento diretto): Babesia spp/Cytauxzoon sp
Genotipizzazione (Sequenziamento diretto): Borrelia spp
Genotipizzazione (Sequenziamento diretto): Ehrlichia spp
Genotipizzazione (Sequenziamento diretto): Giardia spp
Genotipizzazione (Sequenziamento diretto): Hepatozoon spp
Genotipizzazione (Sequenziamento diretto): Mycobacterium spp
Genotipizzazione (Sequenziamento diretto): Rickettsia spp
Genotipizzazione Babesia spp

Giardia spp

Hepadnavirus gatto
Tessuto (fegato)

Hepatozoon spp
L’indagine si esegue su sangue periferico, midollo emopoietico e milza, sia nel cane che nel gatto.

Herpesvirus gatto
Tampone orale, tampone nasale, tampone congiuntivale, lavaggio bronco-alveolare

Herpes virus equino tipo 1 (EHV1)
Sangue intero in K3EDTA, tampone nasofaringeo, lavaggio tracheale o bronco-alveolare, organi (polmone, fegato, reni), liquodo cefalorachidiano

Herpes virus equino tipo 4 (EHV4)
Sangue intero in K3EDTA, tampone nasofaringeo, lavaggio tracheale o bronco-alveolare, organi (polmone, fegato, reni), liquodo cefalorachidiano

Herpesvirus cane
Tampone vaginale, tampone prepuziale, sperma, lavaggio bronco-alveolare

Leishmania infantum
Sangue intero in K3EDTA, midollo in K3EDTA, aspirato linfonodale, liquido cefalo-rachidiano, umor acqueo, biopsia cutanea, tampone oculo-congiuntivale, tampone nasale, tampone buccale.
Approfondimenti: LEISHMANIA

Leptospira interrogans
Sangue intero in K3EDTA, urine, lavaggio bronco-alveolare

Malattia Aleutina del furetto
Sangue intero in K3EDTA, tampone rettale, liquido cefalo-rachidiano, organi (polmoni, fegato, rene, milza)

Malattia di Pacheco

Micoplasmi emotropici felini (Mycoplasma haemofelis, Candidatus haemominutum, Candidatus turicensis)
Sangue intero in K3EDTA, midollo emopoietico in K3EDTA

Mycobacterium spp

Mycoplasma haemocanis (canino)
Sangue intero in K3EDTA, midollo emopoietico in K3EDTA

Mycoplasma cynos (vie respiratorie, cane)
Tampone nasale, orale, lavaggio bronco-alveolare

Mycoplasma felis (vie respiratorie, gatto)
Tampone nasale, orale, lavaggio bronco-alveolare

Mycoplasma spp. (vie genitali)
Tampone vaginale

Neospora caninum
Sangue intero in K3EDTA, aspirato midollare, aspirato linfonodale, liquido cefalorachidiano, feci, tampone fecale.

Panleucopenia (Parvovirus felino)
Feci, sangue intero in K3EDTA, midollo emopoietico in K3EDTA

PANNELLO DERMATOFITI (Microsporum canis-Microsporum gypseum-Tricophyton mentagrophytes-Microsporum persicolor)

PANNELLO DIROFILARIA (Dirofilaria immitis-Dirofilaria repens)

PANNELLO FECALE cane (Coronavirus-Cryptosporidium-Giardia-Parvovirus)
PANNELLO FECALE gatto (Coronavirus-Cryptosporidium-Giardia-Parvovirus-Tritrichomonas)

PANNELLO LIQUOR cane (Cimurro-Toxoplasma-Neospora-Leishmania)
PANNELLO LIQUOR gatto (Toxoplasma-Neospora-Coronavirus-Parvovirus)

PANNELLO MALATTIE DA VETTORI cane
Anaplasma (platys-phagocytophilum)-Ehrlichia-Rickettia-Babesia-Leishmania-Bartonella-Hepatozoon
PANNELLO MALATTIE DA VETTORI gatto
Micoplasmi emotropici felini (Mycoplasma haemofelis, Candidatus haemominutum, Candidatus turicensis)-Cytauxzoon-Babesia-Bartonella-Leishmania

PANNELLO RESPIRATORIO gatto
(Calicivirosi-Herpesvirosi-Clamidiosi-Bordetella-Mycoplasma felis-Aelurostrongylus)
PANNELLO RESPIRATORIO cane
(Cimurro-Parainfluenza-CAV2-Bordetella-Mycoplasma cynos-Angiostrongilus)

Papilloma virus

Papillomavirus bovino
Sangue intero in K3EDTA (refrigerato) o 2 tamponi buccali. Refertazione in 10-15 giorni.

Parainfluenza Virus (CPiV)
Tampone/brush orale, tampone/brush tonsillare, aspirato linfonodale

Parvovirus cane
Feci, sangue intero in K3EDTA, midollo emopoietico in K3EDTA

Pneumocystis carinii
Lavaggio bronco-alveolare, tampone orale. Esame eseguito in service. Refertazione entro 7 gg. lavorativi.

Polyomavirus degli psittacidi
Sangue intero in K3EDTA, piume strappate (non cadute), tampone orale, organi (fegato, milza, rene)

Ricerca e Identificazione funghi (MOMENTANEAMENTE NON DISPONIBILE)

Rickettsia spp
Sangue intero in K3EDTA, aspirato midollare, aspirato linfonodale, liquido cefalorachidiano, liquido articolare.

Theileria equi/Babesia caballi
Sangue intero in K3EDTA

Toxoplasma gondii
Liquido cefalo-rachidiano, lavaggio bronco-alveolare, sangue intero in K3EDTA, feci, frammento di muscolo da conservare in soluzione fisiologica

Tritrichomonas foetus
Tampone fecale, feci.
Approfondimenti: Tritrichomonas foetus

Troglostrongylus brevior/subcrenatus
Lavaggio bronco-alveolare

Wolbachia sp
Sangue intero in K3EDTA

Contatti e riferimenti

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