Esami laboratorio: PCR

E’ stata creata una tabella con le indagini di biologia molecolare offerte dal Laboratorio con un dettaglio relativo ai substrati biologici che possono essere inviati. Se avete un caso particolare o necessitate di ulteriori informazioni vi preghiamo di contattare il Laboratorio prima di inviare i campioni.

La metodica PCR permette di individuare la presenza di un agente infettivo, tramite il reperimento del suo DNA o RNA. Inoltre la metodica da noi offerta prevede, oltre alla segnalazione o meno relativa all’agente infettivo ricercato, per alcuni agenti infettivi anche una valutazione semiquantitativa dello stesso. La quantificazione del DNA è di particolare interesse in corso di leishmaniosi.

Per ogni agente infettivo da noi ricercato sono segnalati i campioni su cui è possibile eseguire la ricerca e alcuni commenti. La ricerca può anche essere eseguita su tessuti freschi, conservati in soluzione fisiologica. Purtroppo i campioni tissutali conservati in formalina, presentano una degradazione del DNA che può determinare una negativizzazione del campione. E’ indispensabile contattare il Laboratorio prima di ogni richiesta speciale per valutare caso per caso l’idoneità del campione.

Si suggerisce di richiedere dei pannelli di malattie infettive invece che selezionare singole infezioni, per poi essere costretti ad integrare le richieste in caso di negatività, con inevitabile spreco di tempo e di risorse economiche. Infatti i nostri profili sono estremamente vantaggiosi dal punto di vista economico, perche’ la possibilità di sfruttare percorsi comuni e l’automazione di cui siamo dotati permette di ridurre in modo sostanziale il costo complessivo, nettamente inferiore rispetto a quello che si ottiene sommando le singole indagini.

Durante i mesi estivi è preferibile mantenere refrigerati i campioni. PCR non devono venire in contatto con terreni di trasporto o altro materiale.

I tempi di refertazione sono attualmente di circa 2-5 gg. lavorativi.

Per la genotipizzazione i tempi di refertazione son pari a 10 giorni.

Il costo degli esami di biologia molecolare si riferisce al singolo agente ricercato, da singolo campione biologico. Nel caso si richieda un esame su più di un campione, ogni ricerca aggiuntiva è ridotta del 50% rispetto al costo originale.

 

ESAMI – vedi anche l’elenco aggiornato, con tutti i substrati che possono essere indagati

Adenovirus respiratorio (CAV2)
Tampone orale, tampone oculo-congiuntivale, espettorato, lavaggio bronco-alveolare, biopsia.

Aelurostrongylus abstrusus
Feci, tampone fecale, tampone orale, tampone oculo-congiuntivale, tampone nasale, espettorato, lavaggio bronco-alveolare.

Anaplasma phagocytophilum/platis
Sangue intero in K3EDTA, midollo,  aspirato d’organo, liquido cefalo-rachidiano, zecca.

Angiostrongylus vasorum
Sangue intero in K3EDTA, feci, tampone fecale, tampone orale, espettorato, lavaggio bronco-alveolare, biopsia; campione refrigerato.

Aspergillus spp
Sangue intero in K3EDTA, midollo, aspirato linfonodale, aspirato d’organo, urine, versamento, liquido cefalorachidiano, tampone cloacale, umor acqueo, tampone nasale, lavaggio bronco-alveolare , biopsia; campione refrigerato.

Babesia spp
Sangue intero in K3EDTA, midolla, aspirato d’organo, zecca; campione refrigerato.
Approfondimenti: Babesia spp

Babesia spp / Cytauxzoon spp
Sangue intero in K3EDTA, midolla, aspirato d’organo, zecca; campione refrigerato.
Approfondimenti: Babesia spp/Cytauxzoon spp

Bartonella spp
Sangue intero in K3EDTA, midollo, aspirato linfonodale, aspirato d’organo, liquido cefalorachidiano, umor acqueo, liquido articolare, zecca; campione refrigerato.

Bordetella bronchiseptica
Sangue intero in K3EDTA, tampone orale, tampone oculo-congiuntivale, tampone nasale, espettorato, lavaggio bronco-alveolare, biopsia.

Borrelia spp
Midollo, aspirato linfonodale, aspirato d’organo, liquido cefalorachidiano, liquido articolare, biopsia, zecca; campione refrigerato.

Brucella spp.
Sangue intero in K3EDTA, aspirato linfonodale, urine, tampone vaginale, tampone prepuziale, liquido prostatico, liquido seminale, liquido articolare, biopsia; campione refrigerato.

Calicivirus
Sangue intero in K3EDTA, feci, tampone fecale, tampone orale, tampone oculo-congiuntivale, tampone nasale, espettorato, tampone cutaneo, raschiato cutaneo, liquido articolare, lavaggio bronco-alveolare, biopsia; campione refrigerato.

Chlamydophila felis
Feci, tampone fecale, tampone orale, tampone oculo-congiuntivale, tampone nasale, espettorato, tampone vaginale,  lavaggio bronco-alveolare, biopsia; campione refrigerato.

Chlamydophila psittaci (uccelli)
Sangue intero in K3EDTA, feci, tampone fecale, tampone cloacale, tampone orale, tampone oculo-congiuntivale, tampone nasale, lavaggio bronco-alveolare; campione refrigerato.

Cimurro
Sangue intero in K3EDTA, midollo, aspirato linfonodale, aspirato d’organo, urine, liquido cefalorachidiano, feci, tampone fecale, tampone orale, tampone oculo-congiuntivale, tampone nasale, espettorato, tampone cutaneo, raschiato cutaneo, lavaggio bronco-alveolare , biopsia.; campione refrigerato.

Circovirus degli psittacidi
Sangue intero in K3EDTA, feci, tampone fecale, tampone cloacale, penna.

Coronavirus enterico (CANE)
Feci, tampone fecale; campione refrigerato.

Coronavirus respiratorio canino (BCoV)
Tampone orale,  tampone nasale, espettorato, lavaggio bronco-alveolare; campione refrigerato.

Coronavirus (FeCoV/FIP)
Sangue intero in K3EDTA, midollo, aspirato linfonodale, aspirato d’organo, urine, versamento, liquido cefalorachidiano, feci (si consiglia di non inviare feci prelevate da lettiere minerali ,sepiolite), tampone fecale, umor acqueo, tampone vaginale, lavaggio bronco-alveolare, biopsia; campione refrigerato.

SARS-CoV-2 (COVID-19)
Utilizzare esclusivamente il tampone inviato dal Laboratorio. Substrati: tampone nasale, faringeo, laringe, lavaggio-broncoalveolare (bagnare il tampone nel lavaggio), tampone fecale

Cryptococcus neoformans
Sangue intero in K3EDTA, midollo, aspirato linfonodale, aspirato d’organo, urine, versamento, liquido cefalorachidiano, feci, tampone fecale, tampone nasale, espettorato, liquido articolare, lavaggio bronco-alveolare, biopsia; campione refrigerato.

Cryptosporidium spp
Feci, tampone fecale.

Dermatofiti
Tampone cutaneo, raschiato cutaneo, biopsia, croste; campione refrigerato.
(è possibile selezionare uno o più agenti fungini tra M. canis, M. gypseum, T. mentagrophytes, M. pericolor)

Dirofilaria immitis
Sangue intero in K3EDTA, biopsia; campione refrigerato.

Dirofilaria repens
Sangue intero in K3EDTA, biopsia; campione refrigerato.

Ehrlichia canis (CME)
Sangue intero in K3EDTA, midollo, aspirato linfonodale, aspirato d’organo, liquido cefalorachidiano, umor acqueo, liquido articolare, zecca; campione refrigerato.

Encephalitozoon cuniculi
Urine, tampone oculo-congiuntivale, biopsia; campione refrigerato.

Epatite infettiva di Rubarth (CAV1)
Tampone orale, tampone oculo-congiuntivale, espettorato, lavaggio bronco-alveolare, biopsia; campione refrigerato.

FeLV (ricerca RNA virale)
Sangue intero in K3EDTA, midollo, aspirato linfonodale, aspirato d’organo, liquido cefalorachidiano, tampone orale, tampone oculo-congiuntivale, umor acqueo, biopsia; campione refrigerato.
Approfondimenti:FELV

FeLV (ricerca del Provirus)
Sangue intero in K3EDTA, midollo, aspirato linfonodale, aspirato d’organo, liquido cefalorachidiano, tampone orale, tampone oculo-congiuntivale, umor acqueo, biopsia; campione refrigerato.
Approfondimenti: FELV

FIV
Sangue in K3EDTA,midollo, liquido cefalorachidiano, tampone orale, umor acqueo; campione refrigerato.

Genotipizzazione (sequenziamento diretto) per Parvovirosi
Genotipizzazione (Sequenziamento diretto): Anaplasma spp
Genotipizzazione (Sequenziamento diretto): Babesia spp
Genotipizzazione (Sequenziamento diretto): Babesia spp/Cytauxzoon sp
Genotipizzazione (Sequenziamento diretto): Borrelia spp
Genotipizzazione (Sequenziamento diretto): Ehrlichia spp
Genotipizzazione (Sequenziamento diretto): Giardia spp
Genotipizzazione (Sequenziamento diretto): Hepatozoon spp
Genotipizzazione (Sequenziamento diretto): Rickettsia spp
Genotipizzazione Babesia spp

Giardia spp
Feci, tampone fecale; campione refrigerato.
In caso di positività, si può richiedere come ulteriore esame la GENOTIPIZZAZIONE dell’agente infettivo

Hepadnavirus gatto
Sangue in K3EDTA, biopsia (fegato); campione refrigerato.

Hepatozoon spp
Sangue intero in K3EDTA, midollo, aspirato linfonodale, aspirato d’organo, liquido cefalorachidiano, liquido articolare, biopsia, zecca; campione refrigerato.

Herpesvirus cane
Sangue intero in K3EDTA, tampone orale, tampone oculo-congiuntivale, umor acqueo, tampone nasale, espettorato, tampone vaginale, tampone prostatico, liquido prostatico, liquido seminale, lavaggio bronco-alveolare, biopsia; campione refrigerato.

Herpesvirus gatto
Sangue intero in K3EDTA, versamento, tampone orale, tampone oculo-congiuntivale, umor acqueo, tampone nasale, espettorato, tampone vaginale, tampone prostatico, liquido seminale, tampone cutaneo, raschiato cutaneo, lavaggio bronco-alveolare, biopsia; campione refrigerato.

Herpes virus equino da tipo 1 (EHV1) a tipo 5 (EHV5)
Liquido cefalorachidiano, tampone orale, umor acqueo, tampone nasale, lavaggio bronco-alveolare, biopsia; campione refrigerato.

Leishmania infantum
Sangue intero in K3EDTA, midollo, aspirato linfonodale, aspirato d’organo, liquido cefalorachidiano, urine, tampone orale, tampone oculo-congiuntivale, umor acqueo, tampone vaginale, liquido prostatico, liquido seminale, tampone cutaneo, raschiato cutaneo, liquido articolare, biopsia, zecca; campione refrigerato.
Approfondimenti: LEISHMANIA

Leptospira interrogans
Sangue intero in K3EDTA, aspirato d’organo, urine, versamento, liquido cefalorachidiano, liquido articolare, lavaggio bronco-alveolare, biopsia; campione refrigerato.

Malattia Aleutina del furetto
Sangue intero in K3EDTA, liquido cefalorachidiano, tampone fecale, biopsia; campione refrigerato.

Malattia di Pacheco
Sangue intero in K3EDTA, feci, tampone cloacale, penna

Micoplasmi emotropici cane
Sangue intero in K3EDTA, midollo, aspirato linfonodale, liquido articolare; campione refrigerato.

Micoplasmi emotropici felini (Mycoplasma haemofelis, Candidatus haemominutum, Candidatus turicensis)
Sangue intero in K3EDTA, midollo, liquido articolare; campione refrigerato.

Mycoplasma cynos (vie respiratorie, cane)
Tampone orale, tampone oculo-congiuntivale, tampone nasale, espettorato, lavaggio bronco-alveolare , biopsia.; campione refrigerato.

Mycoplasma felis (vie respiratorie, gatto)
Tampone orale, tampone oculo-congiuntivale, tampone nasale, espettorato, lavaggio bronco-alveolare , biopsia.; campione refrigerato.

Mycoplasma spp. (vie genitali cane e gatto)
Tampone vaginale, tampone prostatico, liquido prostatico, liquido seminale, biopsia; campione refrigerato.

Mycoplasma spp. (vie respiratorie e genitali per tutte le specie diverse da cane e gatto)
Tampone orale, tampone oculo-congiuntivale, umor acqueo, tampone nasale, espettorato, tampone vaginale, tampone prostatico, liquido articolare, lavaggio bronco-alveolare biopsia; campione refrigerato.

Neospora caninum
Sangue intero in K3EDTA, midollo, aspirato linfonodale, liquido cefalorachidiano, feci, liquido articolare, lavaggio bronco-alveolare , biopsia.; campione refrigerato.

Panleucopenia (Parvovirus felino)
Feci, sangue intero in K3EDTA, midollo emopoietico in K3EDTA

PANNELLO DERMATOFITI (Microsporum canis-Microsporum gypseum-Tricophyton mentagrophytes-Microsporum persicolor)

PANNELLO DIROFILARIA (Dirofilaria immitis-Dirofilaria repens)

PANNELLO FECALE cane (Coronavirus-Cryptosporidium-Giardia-Parvovirus)
PANNELLO FECALE gatto (Coronavirus-Cryptosporidium-Giardia-Parvovirus-Tritrichomonas)

PANNELLO LIQUOR cane (Cimurro-Toxoplasma-Neospora-Leishmania)
PANNELLO LIQUOR gatto (Toxoplasma-Neospora-Coronavirus-Parvovirus)

PANNELLO MALATTIE DA VETTORI cane
Anaplasma (platys-phagocytophilum)-Ehrlichia-Rickettia-Babesia-Leishmania-Bartonella-Hepatozoon
PANNELLO MALATTIE DA VETTORI gatto
Micoplasmi emotropici felini (Mycoplasma haemofelis, Candidatus haemominutum, Candidatus turicensis)-Cytauxzoon-Babesia-Bartonella-Leishmania

PANNELLO RESPIRATORIO gatto
(Calicivirus-Herpes virus-Chlamydia felis-Bordetella-Aelurostrongylus abstrusus- Mycoplasma felis)

PANNELLO RESPIRATORIO cane
(Cimurro-Parainfluenza-CAV2-Bordetella-Mycoplasma cynos-Angiostrongilus)

Papilloma virus gatto
Tampone cutaneo, raschiato cutaneo; campione refrigerato.

Papillomavirus bovino
Sangue intero in K3EDTA (refrigerato) o 2 tamponi buccali. Refertazione in 10-15 giorni.

Parainfluenza Virus (CPiV)
Aspirato linfonodale, tampone orale, tampone oculo-congiuntivale, tampone nasale, espettorato, lavaggio bronco-alveolare , biopsia.; campione refrigerato.

Parvovirus cane/gatto
Sangue intero in K3EDTA, midollo, aspirato linfonodale, aspirato d’organo, liquido cefalorachidiano, feci, tampone fecale.

Pneumocystis spp
Lavaggio bronco-alveolare. Refertazione entro 7 gg. lavorativi.

Polyomavirus degli psittacidi
Sangue intero in K3EDTA, aspirato d’organo, feci, tampone fecale, tampone cloacale, penne strappate (non cadute), tampone orale.

Ricerca e Identificazione funghi 
Sangue intero in K3EDTA, aspirato linfonodale, aspirato d’organo, urine, liquido cefalorachidiano, tampone nasale, tampone cutaneo, raschiato cutaneo, lavaggio bronco-alveolare, biopsia, croste; campione refrigerato.

Rickettsia spp
Sangue intero in K3EDTA, midollo, aspirato linfonodale, aspirato d’organo, liquido cefalorachidiano, liquido articolare, zecca.

Theileria equi/Babesia caballi
Sangue intero in K3EDTA

Toxoplasma gondii
Sangue intero in K3EDTA, midollo, aspirato linfonodale, aspirato d’organo, urine, versamento, liquido cefalorachidiano, feci, umor acqueo, lavaggio bronco-alveolare, biopsia; campione refrigerato.

Tritrichomonas foetus
Feci, tampone fecale,
Approfondimenti: Tritrichomonas foetus

Wolbachia sp
Sangue intero in K3EDTA

Contatti e riferimenti

AREA RISERVATA UTENTI LABORATORIO

*Come richiedere l’accesso? 

PUBBLICAZIONI


Tutte le pubblicazioni